Große Teile der Gemeinde stehen unter Landschaftsschutz. Das Landschaftsschutzgebiet Gundelfingen-Wildtal-Heuweiler umfasst die Wälder und Freiflächen östlich der geschlossenen Siedlungsbereiche von Gundelfingen und Wildtal und reicht bis auf die Gemarkung unseres Nachbarorts Heuweiler.  Wesentlicher Schutzzweck ist die Erhaltung der typischen Vorbergzone des Schwarzwaldes mit den großflächigen Waldgebieten und Wiesen, die einen zusammenhängenden ökologischen Raum von besonderer Eigenart, Vielfalt und Schönheit darstellen, der bedeutende Erholungsfunktionen mit regionalem und überregionalem Einzugsbereich erfüllt.

Eine besondere Auszeichnung für die Gemeinde Gundelfingen und ihre besonnene Nutzung der Gemeindewälder ist die Ausweisung von Teilen des Gundelfinger Waldes und der angrenzenden Streuobstwiesen als NATURA 2000- Schutzgebiet mit europäischer Bedeutung. Das FFH-Gebiet Kandel, Roßkopf und Zartener Becken besteht aus mehreren Teilflächen, davon zwei in den Wäldern und Obstwiesen von Gundelfingen und Wildtal.